Juanjo Guarnido è nato a Granada, in Spagna, nel 1967, ed è lì che ha ottenuto il suo diploma d’arte. Successivamente, sempre a Granada, ha collaborato alla realizzazione di diverse fanzine. Durante questi anni ha inoltre pubblicato molte illustrazione per Cómics Forum (un’etichetta della Planeta DeAgostini) per le pubblicazioni spagnole della Marvel.
In seguito si è spostato a Madrid, dove per tre anni ha lavorato sulle serie TV dello studio di animazione Lapiz Azul. Nel 1993 si è trasferito a Parigi per lavorare come animatore alla Walt Disney di Montreuil, fino a che lo studio non ha chiuso.
Avendo però sempre avuto il fumetto nel cuore, pazientemente comincia la lunga produzione del suo primo album, il volume 1 di Blacksad (Dargaud), Quelque part entre les ombres.
Da allora, anche mentre lavora su altri progetti come Sorcelleries (Dargaud) con Teresa Valero, o Voyageur (Glénat, progetto collettivo), dedica la maggior parte delle sue energie su Blacksad, un’opera indispensabile per qualsiasi appassionato di fumetti.